Here is a partial list of covid sequences from various patients. You can actually do the sequence comparisons yourself, but yes they match the reference genome.

Checking out the first on the reference list:

ORIGIN

1 cttgttctta cctttctttt ccaatgttac ttggttccat gctatacatg tctctgggac

61 caatggtact aagaggtttg ataaccctgt cctaccattt aatgatggtg tttattttgc

121 ttccactgag aagtctaaca taataagagg ctggattttt ggtactactt tagattcgaa

181 gacccagtcc ctacttattg ttaataacgc tactaatgtt gttattaaag tctgtgaatt

241 tcaattttgt aatgatccat ttttgggtgt ttattaccac aaaaacaaca aaagttggat

301 ggaaagtgag ttcagagttt attctagtgc gaataattgc acttttgaat atgtctctca

361 gccttttctt atggaccttg aaggaaaaca gggtaatttc aaaaatctta gggaatttgt

421 gtttaagaat attgatggtt attttaaaat atattctaag cacacgccta ttaatttagt

481 gcgtgatctc cctcagggtt tttcggcttt agaaccattg gtagatttgc caataggtat

541 taacatcact aggtttcaaa ctttacttgc tttacataga agttatttga ctcctggtga

601 ttcttcttca ggttggacag ctggtgctgc agcttattat gtgggttatc ttcaacctag

661 gacttttcta ttaaaatata atgaaaatgg aaccattaca gatgctgtag actgtgcact

721 tgaccctctc tcagaaacaa agtgtacgtt gaaatccttc actgtagaaa aaggaatcta

781 tcaaacttct aactttagag tccaaccaac agaatctatt gttagatttc ctaatattac

841 aaacttgtgc ccttttggtg aagtttttaa cgccaccaga tttgcatctg tttatgcttg

901 gaacaggaag agaatcagca actgtgttgc tgattattct gtcctatata attccgcatc

961 attttccact tttaagtgtt atggagtgtc tcctactaaa ttaaatgatc tctgctttac

1021 taatgtctat gcagattcat ttgtaattag aggtgatgaa gtcagacaaa tcgctccagg

1081 gcaaactgga aagattgctg attataatta taaattacca gatgatttta caggctgcgt

1141 tatagcttgg aattctaaca atcttgattc taaggttggt ggtaattata attacctgta

1201 tagattgttt aggaagtcta atctcaaacc ttttgagaga gatatttcaa ctgaaatcta

1261 tcaggccggt agcacacctt gtaatggtgt tgaaggtttt aattgttact ttcctttaca

1321 atcatatggt ttccaaccca ctaatggtgt tggttaccaa ccatacagag tagtagtact

1381 ttcttttgaa cttctacatg caccagcaac tgtttgtgga cctaaaaagt ctactaattt

1441 ggttaaaaac aaatgtgtca atttcaactt caatggttta acaggcacag gtgttcttac

1501 tgagtctaac aaaaagtttc tgcctttcca acaatttggc agagacattg ctgacactac

1561 tgatgctgtc cgtgatccac agacacttga gattcttgac attacaccat gttcttttgg

1621 tggtgtcagt gttataacac caggaacaaa tacttctaac caggttgctg ttctttatca

1681 ggatgttaac tgcacagaag tccctgttgc tattcatgca gatcaactta ctcctacttg

1741 gcgtgtttat tctacaggtt ctaatgtttt tcaaacacgt gcaggctgtt taataggggc

1801 tgaacatgtc aacaactcat atgagtgtga catacccatt ggtgcaggta tatgcgctag

1861 ttatcagact cagactaatt ctcctcggcg ggcacgtagt gtagctagtc aatccatcat

1921 tgcctacact atgtcacttg gtgcagaaaa ttcagttgct tactctaata actctattgc

1981 catacccaca aattttacta ttagtgttac cacagaaatt ctaccagtgt ctatgaccaa

2041 gacatcagta gattgtacaa tgtacatttg tggtgattca actgaatgca gcaatctttt

2101 gttgcaatat ggcagttttt gtacacaatt aaaccgtgct ttaactggaa tagctgttga

2161 acaagacaaa aacacccaag aagtttttgc acaagtcaaa caaatttaca aaacaccacc

2221 aattaaagat tttggtggtt ttaatttttc acaaatatta ccagatccat caaaaccaag

2281 caagaggtca tttattgaag atctactttt caacaaagtg acacttgcag atgctggctt

2341 catcaaacaa tatggtgatt gccttggtga tattgctgct agagacctca tttgtgcaca

2401 aaagtttaac ggccttactg ttttgccacc tttgctcaca gatgaaatga ttgctcaata

2461 cacttctgca ctgttagcgg gtacaatcac ttctggttgg acctttggtg caggtgctgc

2521 attacaaata ccatttgcta tgcaaatggc ttataggttt aatggtattg gagttacaca

2581 gaatgttctc tatgagaacc aaaaattgat tgccaaccaa tttaatagtg ctattggcaa

2641 aattcaagac tcactttctt ccacagcaag tgcacttgga aaacttcaag atgtggtcaa

2701 ccaaaatgca caagctttaa acacgcttgt taaacaactt agctccaatt ttggtgcaat

2761 ttcaagtgtt ttaaatgata tcctttcacg tcttgacaaa gttgaggctg aagtgcaaat

2821 tgataggttg atcacaggca gacttcaaag tttgcagaca tatgtgactc aacaattaat

2881 tagagctgca gaaatcagag cttctgctaa tcttgctgct actaaaatgt cagagtgtgt

2941 acttggacaa tcaaaaagag ttgatttttg tggaaagggc tatcatctta tgtccttccc

3001 tcagtcagca cctcatggtg tagtcttctt gcatgtgact tatgtccctg cacaagaaaa

3061 gaacttcaca actgctcctg ccatttgtca tgatggaaaa gcacactttc ctcgtgaagg

3121 tgtctttgtt tcaaatggca cncnctggtt tgtaacacaa aggaattttt atgaaccnca

3181 aatcattact acagacaaca catttgtgtc tggtaactgt gatgttgtaa taggaattgt

3241 caacaacnca gtttatgatc ctttgcaacc tgaattagac tcattcaagg aggagttaga

3301 taaatatttt aagaatcata catcaccaga tgttgattta ggtgacatct ctggcattaa

3361 tgcttcagtt gtaaacattc aaaaagaaat tgaccgcctc aatgaggttg ccaagaattt

3421 aaatgaatct ctcatcgatc tccaagaact tggaaagtat gagcagtata taaaanggcc

3481 a

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